Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATRXP46100 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATRXP46100 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATRXP46100 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms