Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTPRZ1P23471 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRZ1P23471 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms