Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD53P19397 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD53P19397 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD53P19397 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms