Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF3P18847 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF3P18847 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF3P18847 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms