Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGPD2P0DJD1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms