Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP9BO43861 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms