Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APAF1O14727 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APAF1O14727 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APAF1O14727 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APAF1O14727 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APAF1O14727 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APAF1O14727 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APAF1O14727 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APAF1O14727 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APAF1O14727 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APAF1O14727 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APAF1O14727 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APAF1O14727 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APAF1O14727 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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