Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms