Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F8A0AVK6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms