Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3AQ9Y6K1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT3AQ9Y6K1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT3AQ9Y6K1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms