Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMCD1Q9NZU5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMCD1Q9NZU5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms