Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN3BQ9NY72 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN3BQ9NY72 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN3BQ9NY72 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms