Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGAP3Q9NP61 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARFGAP3Q9NP61 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms