Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELL3Q9HB65 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELL3Q9HB65 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ELL3Q9HB65 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms