Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM7Q9C029 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM7Q9C029 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM7Q9C029 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms