Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX27Q96L92 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX27Q96L92 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX27Q96L92 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms