Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOXF1Q8NHV9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms