Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOT1Q8IXI2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOT1Q8IXI2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOT1Q8IXI2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms