Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC103Q8IW40 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC103Q8IW40 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC103Q8IW40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms