Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM17Q86X19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms