Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC3Q7Z5M5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMC3Q7Z5M5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms