Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM43Q6ZSC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RBM43Q6ZSC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM43Q6ZSC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms