Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00299Q6ZSB3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms