Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASC1Q6TDU7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CASC1Q6TDU7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASC1Q6TDU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASC1Q6TDU7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms