Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIPR1Q53HC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIPR1Q53HC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIPR1Q53HC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms