Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL22Q53GT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL22Q53GT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms