Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT71Q3SY84 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT71Q3SY84 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT71Q3SY84 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms