Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRF5Q13568 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRF5Q13568 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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