Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ZFPL1-204ENST00000526289 980 ntTSL 217.53■□□□□ 0.44e-10■■■■■ 37
TARDBPQ13148 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 37
TARDBPQ13148 KAZN-206ENST00000491547 5592 ntTSL 217.67■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 37
TARDBPQ13148 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 37
TARDBPQ13148 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 37
TARDBPQ13148 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 37
TARDBPQ13148 RAB14-202ENST00000451303 711 ntTSL 38.76□□□□□ -1.017e-8■■■■■ 37
TARDBPQ13148 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.237e-8■■■■■ 37
TARDBPQ13148 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 323.83■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 37
TARDBPQ13148 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 318.62■□□□□ 0.575e-7■■■■■ 37
TARDBPQ13148 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 313.8□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 37
TARDBPQ13148 PACS1-205ENST00000527224 3024 ntTSL 218.44■□□□□ 0.545e-11■■■■■ 37
TARDBPQ13148 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-11■■■■■ 37
TARDBPQ13148 PACS1-213ENST00000533756 578 ntTSL 49.79□□□□□ -0.845e-11■■■■■ 37
TARDBPQ13148 GATA2-205ENST00000492608 844 ntTSL 319.64■□□□□ 0.736e-13■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 219.02■□□□□ 0.646e-13■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 OSBPL2-211ENST00000622332 754 ntTSL 39.99□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 36.9
TARDBPQ13148 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 32.75□□□□□ -1.972e-10■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.114e-19■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.224e-19■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 CSTF3-207ENST00000526480 479 ntTSL 36.61□□□□□ -1.354e-19■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 LRRC8D-205ENST00000525774 588 ntTSL 424.06■■□□□ 1.449e-8■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.159e-8■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.229e-8■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 LRRC8D-206ENST00000527156 922 ntTSL 211.81□□□□□ -0.529e-8■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 LRRC8D-207ENST00000532201 597 ntTSL 411.46□□□□□ -0.579e-8■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.969e-8■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 LRRC8D-203ENST00000414841 666 ntTSL 38.28□□□□□ -1.089e-8■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 LRRC8D-204ENST00000441269 905 ntTSL 36.82□□□□□ -1.329e-8■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.034e-7■■■■■ 36.8
TARDBPQ13148 LINC01088-207ENST00000511241 679 ntTSL 28.6□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 36.7
TARDBPQ13148 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 36.7
TARDBPQ13148 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 215.43■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 36.7
TARDBPQ13148 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 221.07■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 36.7
TARDBPQ13148 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 36.7
TARDBPQ13148 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.693e-8■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.933e-8■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.943e-8■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-213ENST00000640437 1620 ntTSL 515.9■□□□□ 0.143e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-205ENST00000602546 762 ntTSL 310.1□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-201ENST00000414209 2194 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-208ENST00000602895 829 ntTSL 39.86□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-209ENST00000602920 625 ntTSL 29□□□□□ -0.973e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-211ENST00000602985 476 ntTSL 38.04□□□□□ -1.123e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-204ENST00000602294 502 ntTSL 27.77□□□□□ -1.173e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-210ENST00000602938 581 ntTSL 27.77□□□□□ -1.173e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.353e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-10■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 526.54■■□□□ 1.844e-7■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 224.43■■□□□ 1.54e-7■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.354e-7■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 521.25■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 319.34■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 RALY-210ENST00000493399 513 ntTSL 514.1□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 IMMP2L-210ENST00000492938 587 ntTSL 312.64□□□□□ -0.399e-11■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 IMMP2L-206ENST00000452753 421 ntTSL 510.69□□□□□ -0.79e-11■■■■■ 36.6
TARDBPQ13148 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-19■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-19■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-11■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.281e-11■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.311e-11■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.461e-11■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.511e-11■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-11■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 FGF13-207ENST00000455663 687 ntTSL 36.27□□□□□ -1.415e-14■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 KEL-208ENST00000479768 1856 ntTSL 512.87□□□□□ -0.359e-18■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 QKI-216ENST00000545346 457 ntTSL 54.66□□□□□ -1.666e-8■■■■■ 36.5
TARDBPQ13148 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.668e-7■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 516.08■□□□□ 0.168e-7■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 413.15□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 36.4
TARDBPQ13148 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.972e-7■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.622e-7■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 HNRNPAB-203ENST00000504796 578 ntTSL 28.56□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 ARMC8-221ENST00000491704 2777 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.586e-10■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.726e-10■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 ARMC8-217ENST00000481646 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.776e-10■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.086e-10■■■■■ 36.3
TARDBPQ13148 ARMC8-202ENST00000460495 2189 ntTSL 27.34□□□□□ -1.236e-10■■■■■ 36.3
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