Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 STE2YFL026W 1296 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 SNF4YGL115W 969 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 NCS6YGL211W 1080 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 ARD1YHR013C 717 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 IMP3YHR148W 552 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YIL168WYIL168W 384 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 RRT7YLL030C 342 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 LOT6YLR011W 576 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 BSC4YNL269W 396 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 COX11YPL132W 903 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 LPL1YOR059C 1353 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YLR345WYLR345W 1530 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 GIC2YDR309C 1152 nt6.65□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 ROT1YMR200W 771 nt6.65□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 JID1YPR061C 906 nt6.65□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt6.65□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt6.65□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 BDS1YOL164W 1941 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YKL202WYKL202W 582 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 MFT1YML062C 1179 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YMR245WYMR245W 621 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 BUD21YOR078W 645 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 IPP1YBR011C 864 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YJR124CYJR124C 1347 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 PAP1YKR002W 1707 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YIL108WYIL108W 2091 nt6.64□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 RRP43YCR035C 1185 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 LDB17YDL146W 1476 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 CBS2YDR197W 1170 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 UTR5YEL035C 501 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 DCV1YFR012W 609 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 ERV14YGL054C 417 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 NSA1YGL111W 1392 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 TFA2YKR062W 987 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 PSR2YLR019W 1194 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YLR379WYLR379W 375 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 PET112YBL080C 1626 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 REX4YOL080C 870 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YOL150CYOL150C 312 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YPK3YBR028C 1578 nt6.63□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 RAV2YDR202C 1056 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 RTT103YDR289C 1230 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YGL214WYGL214W 486 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 MND2YIR025W 1107 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 LAC1YKL008C 1257 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YOR012WYOR012W 414 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 FSF1YOR271C 984 nt6.62□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 EXG2YDR261C 1689 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 CHL4YDR254W 1377 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YBL111CYBL111C 2004 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YCR041WYCR041W 333 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 TRS23YDR246W 660 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 COG2YGR120C 789 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 MMM1YLL006W 1281 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YMR187CYMR187C 1296 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YOR024WYOR024W 324 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 CKS1YBR135W 453 nt6.61□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 RCK1YGL158W 1539 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 HTB1YDR224C 396 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 GTT1YIR038C 705 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YLR194CYLR194C 765 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 CPR6YLR216C 1116 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YBR013CYBR013C 390 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 GRX5YPL059W 453 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 SMK1YPR054W 1167 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 SPS1YDR523C 1473 nt6.6□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 PPZ2YDR436W 2133 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 VRP1YLR337C 2454 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 WTM1YOR230W 1314 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 SHO1YER118C 1104 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 RPB4YJL140W 666 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 ECM1YAL059W 639 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YLR112WYLR112W 420 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 RRT1YBL048W 312 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 YNL017CYNL017C 339 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 SFG1YOR315W 1041 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 MET16YPR167C 786 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 PBI1YPL272C 1554 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 PPS1YBR276C 2424 nt6.59□□□□□ -1.35
TY1A-NL1Q12391 DRS1YLL008W 2259 nt6.59□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 CDC3YLR314C 1563 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PAC10YGR078C 600 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 IST3YIR005W 447 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 SEC72YLR292C 582 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YMR007WYMR007W 381 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 RIT1YMR283C 1542 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 NUP84YDL116W 2181 nt6.58□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YCP4YCR004C 744 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 UPS3YDR185C 540 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 RRP46YGR095C 672 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 CPR7YJR032W 1182 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 USB1YLR132C 873 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 PRE7YBL041W 726 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 ATG16YMR159C 453 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 CKB2YOR039W 777 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1A-NL1Q12391 YOR300WYOR300W 309 nt6.57□□□□□ -1.36
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