Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 MRPS12YNR036C 462 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 ICL1YER065C 1674 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 DSF1YEL070W 1509 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 YNR073CYNR073C 1509 nt5.23□□□□□ -1.57
USB1Q12208 SOH1YGL127C 384 nt5.22□□□□□ -1.57
USB1Q12208 GLN1YPR035W 1113 nt5.22□□□□□ -1.57
USB1Q12208 XBP1YIL101C 1944 nt5.22□□□□□ -1.57
USB1Q12208 RNR3YIL066C 2610 nt5.22□□□□□ -1.57
USB1Q12208 GPB2YAL056W 2643 nt5.22□□□□□ -1.57
USB1Q12208 DEF1YKL054C 2217 nt5.21□□□□□ -1.57
USB1Q12208 GUD1YDL238C 1470 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 AVO1YOL078W 3531 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YTP1YNL237W 1380 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 IMA5YJL216C 1746 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 FLC3YGL139W 2409 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 COX9YDL067C 180 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YJL171CYJL171C 1191 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 HAP3YBL021C 435 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 RAP1YNL216W 2484 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 MNN5YJL186W 1761 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 TEP1YNL128W 1305 nt5.21□□□□□ -1.58
USB1Q12208 VMS1YDR049W 1899 nt5.2□□□□□ -1.58
USB1Q12208 CIS3YJL158C 684 nt5.2□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YNL285WYNL285W 372 nt5.2□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YPR114WYPR114W 948 nt5.2□□□□□ -1.58
USB1Q12208 KKQ8YKL168C 2175 nt5.2□□□□□ -1.58
USB1Q12208 RIO1YOR119C 1455 nt5.2□□□□□ -1.58
USB1Q12208 CSC1YLR241W 2349 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 IVY1YDR229W 1362 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 CDC34YDR054C 888 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 HST2YPL015C 1074 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 DAP1YPL170W 459 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YHL017WYHL017W 1599 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 MDM31YHR194W 1740 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 TAH18YPR048W 1872 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 ALT1YLR089C 1779 nt5.19□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YDL129WYDL129W 876 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 PPM1YDR435C 987 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YHL018WYHL018W 363 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 GEP5YLR091W 882 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 ICT1YLR099C 1185 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 QRI5YLR204W 336 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YNR040WYNR040W 771 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 PFK2YMR205C 2880 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 AAP1YHR047C 2571 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SEC18YBR080C 2277 nt5.18□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 ZRT2YLR130C 1269 nt5.17□□□□□ -1.58
USB1Q12208 ELP3YPL086C 1674 nt5.16□□□□□ -1.58
USB1Q12208 UTP4YDR324C 2331 nt5.16□□□□□ -1.58
USB1Q12208 FRS2YFL022C 1512 nt5.16□□□□□ -1.58
USB1Q12208 PRP24YMR268C 1335 nt5.16□□□□□ -1.58
USB1Q12208 NOP2YNL061W 1857 nt5.15□□□□□ -1.58
USB1Q12208 YMR027WYMR027W 1413 nt5.15□□□□□ -1.58
USB1Q12208 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.15□□□□□ -1.59
USB1Q12208 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.15□□□□□ -1.59
USB1Q12208 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.15□□□□□ -1.59
USB1Q12208 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.15□□□□□ -1.59
USB1Q12208 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.15□□□□□ -1.59
USB1Q12208 LEU5YHR002W 1074 nt5.15□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RPS28AYOR167C 204 nt5.15□□□□□ -1.59
USB1Q12208 ACC1YNR016C 6702 nt5.15□□□□□ -1.59
USB1Q12208 ATG4YNL223W 1485 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YPL277CYPL277C 1464 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RPS5YJR123W 678 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YML6YML025C 861 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YML083CYML083C 1257 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 JNM1YMR294W 1122 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RPO26YPR187W 468 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 BZZ1YHR114W 1902 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 SCT1YBL011W 2280 nt5.14□□□□□ -1.59
USB1Q12208 SIT1YEL065W 1887 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RSA4YCR072C 1548 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RAD24YER173W 1980 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 COX20YDR231C 618 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 PRE3YJL001W 648 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 GCV3YAL044C 513 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 UTP9YHR196W 1728 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 VPS4YPR173C 1314 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 CNE1YAL058W 1509 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 SKS1YPL026C 1509 nt5.13□□□□□ -1.59
USB1Q12208 FOB1YDR110W 1701 nt5.12□□□□□ -1.59
USB1Q12208 HAP2YGL237C 798 nt5.12□□□□□ -1.59
USB1Q12208 MPM1YJL066C 759 nt5.12□□□□□ -1.59
USB1Q12208 MOG1YJR074W 657 nt5.12□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.12□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YNL108CYNL108C 813 nt5.12□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YDR514CYDR514C 1452 nt5.12□□□□□ -1.59
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