Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YJU3YKL094W 942 nt5.69□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 AMD2YDR242W 1650 nt5.69□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 PPT1YGR123C 1542 nt5.69□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.68□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YKL102CYKL102C 306 nt5.68□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 RHO2YNL090W 579 nt5.68□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 ODC2YOR222W 924 nt5.68□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 ABZ1YNR033W 2364 nt5.68□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 ELP3YPL086C 1674 nt5.68□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 SIA1YOR137C 1869 nt5.68□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 PKC1YBL105C 3456 nt5.68□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YKL153WYKL153W 510 nt5.67□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 PRS1YKL181W 1284 nt5.67□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YLR317WYLR317W 435 nt5.67□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 RRT2YBR246W 1164 nt5.67□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 ERG7YHR072W 2196 nt5.67□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 FLC3YGL139W 2409 nt5.67□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 CHL4YDR254W 1377 nt5.67□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YJL171CYJL171C 1191 nt5.66□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 MRPS18YNL306W 654 nt5.66□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 CTF19YPL018W 1110 nt5.66□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 RRN3YKL125W 1884 nt5.66□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 MID1YNL291C 1647 nt5.66□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 UGX2YDL169C 672 nt5.65□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YOL046CYOL046C 675 nt5.65□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 HST2YPL015C 1074 nt5.65□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 HST3YOR025W 1344 nt5.65□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 ILV1YER086W 1731 nt5.65□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 EIS1YMR031C 2532 nt5.65□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 HPF1YOL155C 2904 nt5.64□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 PPH21YDL134C 1110 nt5.64□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 KAE1YKR038C 1161 nt5.64□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 GTO3YMR251W 1101 nt5.64□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 TFB4YPR056W 1017 nt5.64□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 AAP1YHR047C 2571 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 YME1YPR024W 2244 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 BUG1YDL099W 1026 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 YER186CYER186C 921 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 RPS2YGL123W 765 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 HAP2YGL237C 798 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 RMA1YKL132C 1293 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 SRL2YLR082C 1179 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 ASR1YPR093C 867 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 SIP5YMR140W 1470 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 WHI2YOR043W 1461 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 YEL077CYEL077C 3834 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 VBA1YMR088C 1689 nt5.63□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 QDR3YBR043C 2070 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 HEM3YDL205C 984 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 RME1YGR044C 903 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 FAF1YIL019W 1041 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 SML1YML058W 315 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 SPG4YMR107W 348 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 HOR7YMR251W-A 180 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 PSH1YOL054W 1221 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 RPT2YDL007W 1314 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 MCM3YEL032W 2916 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 CCT8YJL008C 1707 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 YPK2YMR104C 2034 nt5.62□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 GPD1YDL022W 1176 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 YDL023CYDL023C 321 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 TAX4YJL083W 1815 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 SFC1YJR095W 969 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 ASK1YKL052C 879 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 SSK1YLR006C 2139 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 NRD1YNL251C 1728 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 PTC4YBR125C 1182 nt5.61□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 DBF4YDR052C 2115 nt5.6□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 GYP1YOR070C 1914 nt5.6□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 SOH1YGL127C 384 nt5.6□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.6□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 ZWF1YNL241C 1518 nt5.59□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 SRY1YKL218C 981 nt5.59□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 RPS3YNL178W 723 nt5.59□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 TAH18YPR048W 1872 nt5.59□□□□□ -1.51
MSH5Q12175 ICL1YER065C 1674 nt5.59□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 FRE3YOR381W 2136 nt5.59□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 OCA5YHL029C 2040 nt5.58□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 DIA3YDL024C 1407 nt5.58□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 BUD32YGR262C 786 nt5.58□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 AIM46YHR199C 933 nt5.58□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 YHM2YMR241W 945 nt5.58□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 MSO1YNR049C 633 nt5.58□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 YPR098CYPR098C 486 nt5.58□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 YKL031WYKL031W 414 nt5.57□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 COX11YPL132W 903 nt5.57□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 ERG1YGR175C 1491 nt5.57□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 VTH1YIL173W 4650 nt5.57□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 VTH2YJL222W 4650 nt5.57□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 DEF1YKL054C 2217 nt5.56□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 ECM3YOR092W 1842 nt5.56□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 PHO86YJL117W 936 nt5.56□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 SRP101YDR292C 1866 nt5.56□□□□□ -1.52
MSH5Q12175 YGL072CYGL072C 360 nt5.55□□□□□ -1.52
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