Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 SFC1YJR095W 969 nt6.54□□□□□ -1.36
TY3A-GQ12173 YKL031WYKL031W 414 nt6.54□□□□□ -1.36
TY3A-GQ12173 MRPL36YBR122C 534 nt6.54□□□□□ -1.36
TY3A-GQ12173 YCL041CYCL041C 495 nt6.54□□□□□ -1.36
TY3A-GQ12173 MKK1YOR231W 1527 nt6.54□□□□□ -1.36
TY3A-GQ12173 FZF1YGL254W 900 nt6.53□□□□□ -1.36
TY3A-GQ12173 BCY1YIL033C 1251 nt6.53□□□□□ -1.36
TY3A-GQ12173 YCK1YHR135C 1617 nt6.53□□□□□ -1.36
TY3A-GQ12173 CDC16YKL022C 2523 nt6.52□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 PHO3YBR092C 1404 nt6.52□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 MRPL13YKR006C 795 nt6.52□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 RPL5YPL131W 894 nt6.52□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 YBR144CYBR144C 315 nt6.52□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 DYS1YHR068W 1164 nt6.51□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 YHM2YMR241W 945 nt6.51□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 ARR3YPR201W 1215 nt6.51□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 SOG2YOR353C 2376 nt6.51□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.5□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt6.5□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 YLR312CYLR312C 1197 nt6.5□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 YMR010WYMR010W 1218 nt6.5□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 LST8YNL006W 912 nt6.5□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 YNR042WYNR042W 429 nt6.5□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 YJR015WYJR015W 1533 nt6.5□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 PMT3YOR321W 2262 nt6.5□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 PRM10YJL108C 1152 nt6.49□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 PGU1YJR153W 1086 nt6.49□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 TMT1YER175C 900 nt6.48□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 GAA1YLR088W 1845 nt6.48□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 YGR182CYGR182C 354 nt6.47□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.47□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 HXT15YDL245C 1704 nt6.47□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 HXT16YJR158W 1704 nt6.47□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 NUD1YOR373W 2556 nt6.47□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 ATG4YNL223W 1485 nt6.47□□□□□ -1.37
TY3A-GQ12173 RRP4YHR069C 1080 nt6.46□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YLR283WYLR283W 945 nt6.46□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 VMA2YBR127C 1554 nt6.46□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 UTR2YEL040W 1404 nt6.45□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YCL065WYCL065W 369 nt6.45□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YGL235WYGL235W 537 nt6.45□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YLR118CYLR118C 684 nt6.45□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 PHB1YGR132C 864 nt6.44□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 TPK1YJL164C 1194 nt6.44□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YLR194CYLR194C 765 nt6.44□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 NMT1YLR195C 1368 nt6.44□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 TIM54YJL054W 1437 nt6.43□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YDL114WYDL114W 927 nt6.43□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YDR154CYDR154C 351 nt6.43□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YRA1YDR381W 681 nt6.43□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YKL151CYKL151C 1014 nt6.43□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 DAL82YNL314W 768 nt6.43□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 RPL21AYBR191W 483 nt6.43□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 KNS1YLL019C 2214 nt6.43□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.42□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.42□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.42□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.42□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 RPS9AYPL081W 594 nt6.42□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YTP1YNL237W 1380 nt6.42□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 ISC1YER019W 1434 nt6.42□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 AVT4YNL101W 2142 nt6.41□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YGR176WYGR176W 348 nt6.41□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YUR1YJL139C 1287 nt6.41□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 NOG2YNR053C 1461 nt6.41□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 AMD1YML035C 2433 nt6.4□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 GLE1YDL207W 1617 nt6.4□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 MHR1YDR296W 681 nt6.4□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 ERP2YAL007C 648 nt6.4□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.4□□□□□ -1.38
TY3A-GQ12173 CHS5YLR330W 2016 nt6.4□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 SHM1YBR263W 1473 nt6.4□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 YNL019CYNL019C 855 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 YNL033WYNL033W 855 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 GDA1YEL042W 1557 nt6.39□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 ARG81YML099C 2643 nt6.38□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 CDC11YJR076C 1248 nt6.38□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt6.38□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 GUD1YDL238C 1470 nt6.38□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 GUF1YLR289W 1938 nt6.38□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 YPR204WYPR204W 3099 nt6.37□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 RSC2YLR357W 2670 nt6.37□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 YAP1801YHR161C 1914 nt6.37□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt6.37□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 PRO3YER023W 861 nt6.37□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 MET8YBR213W 825 nt6.37□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 PYC2YBR218C 3543 nt6.37□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 VRP1YLR337C 2454 nt6.37□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 SLX5YDL013W 1860 nt6.36□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 CEF1YMR213W 1773 nt6.36□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 EMW1YNL313C 2715 nt6.36□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 RRP46YGR095C 672 nt6.36□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 QNS1YHR074W 2145 nt6.36□□□□□ -1.39
TY3A-GQ12173 YBR124WYBR124W 360 nt6.36□□□□□ -1.39
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