Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 STE13YOR219C 2796 nt5.96□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 SUB2YDL084W 1341 nt5.96□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 PRS2YER099C 957 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 DUG1YFR044C 1446 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 LDS1YAL018C 978 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 ELA1YNL230C 1140 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 DAP1YPL170W 459 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 SSK22YCR073C 3996 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 BRL1YHR036W 1416 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 BUG1YDL099W 1026 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 YHC3YJL059W 1227 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 RPL10YLR075W 666 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 YOR300WYOR300W 309 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 RPL21AYBR191W 483 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 MKK2YPL140C 1521 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 PRI2YKL045W 1587 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 TNA1YGR260W 1605 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 CBP4YGR174C 513 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 VMA4YOR332W 702 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 ATF1YOR377W 1578 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 EPS1YIL005W 2106 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 TMT1YER175C 900 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 KTR1YOR099W 1182 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 YPL041CYPL041C 624 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 HRQ1YDR291W 3234 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 RPN11YFR004W 921 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 RPE1YJL121C 717 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 PET112YBL080C 1626 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 MNN5YJL186W 1761 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 CDC19YAL038W 1503 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 XBP1YIL101C 1944 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 DFM1YDR411C 1026 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 LEU5YHR002W 1074 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 LCB3YJL134W 1230 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 POP5YAL033W 522 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 MRPS16YPL013C 366 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 CWC27YPL064C 906 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 YBR124WYBR124W 360 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN8Q08723 AMD2YDR242W 1650 nt5.9□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 HST3YOR025W 1344 nt5.9□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 ILV1YER086W 1731 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 SCT1YBL011W 2280 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 UGX2YDL169C 672 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 JNM1YMR294W 1122 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 MRPS5YBR251W 924 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 ADE12YNL220W 1302 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 GSY2YLR258W 2118 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 NHA1YLR138W 2958 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 MNS1YJR131W 1650 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 YOL163WYOL163W 510 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 YPL102CYPL102C 303 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 ISN1YOR155C 1353 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 DBP9YLR276C 1785 nt5.88□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 SGV1YPR161C 1974 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 CWC21YDR482C 408 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 ATP4YPL078C 735 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 EXG1YLR300W 1347 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 YTP1YNL237W 1380 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 MCH1YDL054C 1461 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 MSS1YMR023C 1581 nt5.87□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 YDL119CYDL119C 924 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 SPO7YAL009W 780 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 ACC1YNR016C 6702 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 TRP5YGL026C 2124 nt5.86□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 GUA1YMR217W 1578 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 UTP4YDR324C 2331 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 YKL223WYKL223W 333 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 SNO4YMR322C 714 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 HSP33YOR391C 714 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 MRP51YPL118W 1035 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 HSP32YPL280W 714 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 TEL2YGR099W 2067 nt5.85□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 RET1YOR207C 3450 nt5.84□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 RHB1YCR027C 630 nt5.84□□□□□ -1.47
RPN8Q08723 YKR023WYKR023W 1593 nt5.84□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 YIR007WYIR007W 2295 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 NSE5YML023C 1671 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 RHO4YKR055W 876 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 SCO2YBR024W 906 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 YMC1YPR058W 924 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 PUF3YLL013C 2640 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 GFA1YKL104C 2154 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 IMA2YOL157C 1770 nt5.83□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 GEP5YLR091W 882 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 EHD3YDR036C 1503 nt5.82□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 TEP1YNL128W 1305 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 TKL1YPR074C 2043 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 YGL235WYGL235W 537 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 RPR2YIR015W 435 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 POR1YNL055C 852 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 RRS1YOR294W 612 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 GLN1YPR035W 1113 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 PYC1YGL062W 3537 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 YAP1801YHR161C 1914 nt5.81□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 RIM101YHL027W 1878 nt5.8□□□□□ -1.48
RPN8Q08723 YEL068CYEL068C 333 nt5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms