Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC3A1Q07837 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC3A1Q07837 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC3A1Q07837 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms