Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.81□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.81□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.81□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.81□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.81□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 YPL102CYPL102C 303 nt5.81□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 LEU5YHR002W 1074 nt5.8□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 MTC5YDR128W 3447 nt5.8□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 YNL017CYNL017C 339 nt5.79□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 YNR040WYNR040W 771 nt5.79□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 YOR200WYOR200W 399 nt5.79□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 GPB2YAL056W 2643 nt5.79□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 GAT1YFL021W 1533 nt5.79□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 GIT1YCR098C 1557 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 ERP2YAL007C 648 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 SEN34YAR008W 828 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 UBC11YOR339C 471 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 KEX2YNL238W 2445 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 GPA2YER020W 1350 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 COR1YBL045C 1374 nt5.78□□□□□ -1.48
TRM12Q04235 RAD3YER171W 2337 nt5.77□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 snR82snR82 268 nt5.77□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 RPL10YLR075W 666 nt5.77□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 APE3YBR286W 1614 nt5.77□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 YDR109CYDR109C 2148 nt5.77□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 CLB1YGR108W 1416 nt5.76□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 YJU3YKL094W 942 nt5.76□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 YLR126CYLR126C 756 nt5.76□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 PRI2YKL045W 1587 nt5.76□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 ATG22YCL038C 1587 nt5.76□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 PRS2YER099C 957 nt5.75□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 DJP1YIR004W 1299 nt5.75□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 TAL1YLR354C 1008 nt5.75□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 MRPS5YBR251W 924 nt5.75□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 HIR1YBL008W 2523 nt5.75□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 XBP1YIL101C 1944 nt5.74□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 DFM1YDR411C 1026 nt5.74□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.74□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.74□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.74□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 ATG12YBR217W 561 nt5.74□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 AMA1YGR225W 1782 nt5.74□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 PTK2YJR059W 2457 nt5.73□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 UGX2YDL169C 672 nt5.73□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 SPO7YAL009W 780 nt5.73□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 PXL1YKR090W 2121 nt5.73□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 MKK1YOR231W 1527 nt5.73□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 SEC20YDR498C 1152 nt5.72□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 RME1YGR044C 903 nt5.72□□□□□ -1.49
TRM12Q04235 PYC1YGL062W 3537 nt5.71□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 SHP1YBL058W 1272 nt5.71□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 GUA1YMR217W 1578 nt5.71□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 HSP78YDR258C 2436 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 ISN1YOR155C 1353 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 ATO3YDR384C 828 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 HAP2YGL237C 798 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 EGD2YHR193C 525 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 ASK1YKL052C 879 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 SNN1YNL086W 309 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YOL131WYOL131W 327 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 RPN7YPR108W 1290 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YBR144CYBR144C 315 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 ERC1YHR032W 1746 nt5.7□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 NMT1YLR195C 1368 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 SLX5YDL013W 1860 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 DIA3YDL024C 1407 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 IRC7YFR055W 1023 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 VHT1YGR065C 1782 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YML082WYML082W 1950 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 ALD6YPL061W 1503 nt5.69□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 POP1YNL221C 2628 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 AAD15YOL165C 432 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 RPS9AYPL081W 594 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YPK2YMR104C 2034 nt5.68□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 RPS2YGL123W 765 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 RRP4YHR069C 1080 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YEH1YLL012W 1722 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 MRK1YDL079C 1506 nt5.67□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 ATP1YBL099W 1638 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 VRP1YLR337C 2454 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 CHO1YER026C 831 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 LYS12YIL094C 1116 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 NPA3YJR072C 1158 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 STM1YLR150W 822 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 MPA43YNL249C 1629 nt5.66□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YDL114WYDL114W 927 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YER186CYER186C 921 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 YGR127WYGR127W 939 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 APS3YJL024C 585 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 SCO2YBR024W 906 nt5.65□□□□□ -1.5
TRM12Q04235 HXT15YDL245C 1704 nt5.65□□□□□ -1.51
TRM12Q04235 HXT16YJR158W 1704 nt5.65□□□□□ -1.51
TRM12Q04235 YBL070CYBL070C 321 nt5.64□□□□□ -1.51
TRM12Q04235 AMD1YML035C 2433 nt5.63□□□□□ -1.51
TRM12Q04235 YDL057WYDL057W 987 nt5.63□□□□□ -1.51
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