Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YDL057WYDL057W 987 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 KIN1YDR122W 3195 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 SGE1YPR198W 1632 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 EFM1YHL039W 1758 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 ELP3YPL086C 1674 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 GUD1YDL238C 1470 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 SES1YDR023W 1389 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 RRP4YHR069C 1080 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 HSP26YBR072W 645 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 ARR3YPR201W 1215 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 LST8YNL006W 912 nt7□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 MLC1YGL106W 450 nt6.99□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 PGM1YKL127W 1713 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 TEA1YOR337W 2280 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 CHS5YLR330W 2016 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 MRPL13YKR006C 795 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 BSC4YNL269W 396 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 CLN1YMR199W 1641 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 KNH1YDL049C 807 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 GIR2YDR152W 798 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 FZF1YGL254W 900 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 MRPL36YBR122C 534 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 NSE5YML023C 1671 nt6.96□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 VMA2YBR127C 1554 nt6.96□□□□□ -1.29
SYF1Q04048 YDL114WYDL114W 927 nt6.96□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YNL165WYNL165W 1221 nt6.96□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 RPS9AYPL081W 594 nt6.96□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 KKQ8YKL168C 2175 nt6.96□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 SPS22YCL048W 1392 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YMR155WYMR155W 1644 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 DMA1YHR115C 1251 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 COA1YIL157C 594 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 ERI1YPL096C-A 207 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YGL036WYGL036W 2730 nt6.94□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 ADE13YLR359W 1449 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 GYP8YFL027C 1494 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YCL065WYCL065W 369 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YRA1YDR381W 681 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 ERG3YLR056W 1098 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YLR194CYLR194C 765 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 ATF1YOR377W 1578 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 MCM3YEL032W 2916 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 AMD1YML035C 2433 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YDR154CYDR154C 351 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 RPT3YDR394W 1287 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 SSO1YPL232W 873 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 SHM1YBR263W 1473 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 TFC6YDR362C 2019 nt6.91□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 APE3YBR286W 1614 nt6.91□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 CRP1YHR146W 1398 nt6.91□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 CMR1YDL156W 1569 nt6.91□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 GLE1YDL207W 1617 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YBR284WYBR284W 2394 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 DJP1YIR004W 1299 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 RRN10YBL025W 438 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YCL041CYCL041C 495 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YPR204WYPR204W 3099 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF1Q04048 YFL052WYFL052W 1398 nt6.9□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 HMS2YJR147W 1077 nt6.89□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 TEP1YNL128W 1305 nt6.89□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 VRP1YLR337C 2454 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YFR006WYFR006W 1608 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 VPS61YDR136C 573 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YDR401WYDR401W 564 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 HSP12YFL014W 330 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 HST2YPL015C 1074 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YDR109CYDR109C 2148 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 GAA1YLR088W 1845 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 OPT1YJL212C 2400 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 SMK1YPR054W 1167 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 FET4YMR319C 1659 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 MPA43YNL249C 1629 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 GLN3YER040W 2193 nt6.86□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 QNS1YHR074W 2145 nt6.86□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 NUD1YOR373W 2556 nt6.86□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 ORC5YNL261W 1440 nt6.86□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YLR118CYLR118C 684 nt6.86□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YLR283WYLR283W 945 nt6.86□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 DAL82YNL314W 768 nt6.86□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 AIM3YBR108W 2844 nt6.85□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YEA6YEL006W 1008 nt6.85□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 PRM10YJL108C 1152 nt6.85□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 TPK1YJL164C 1194 nt6.85□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YBR124WYBR124W 360 nt6.85□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 GIT1YCR098C 1557 nt6.85□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 FRS2YFL022C 1512 nt6.85□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YAP1801YHR161C 1914 nt6.84□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YDR278CYDR278C 318 nt6.84□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 ORM1YGR038W 669 nt6.84□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 YGR176WYGR176W 348 nt6.84□□□□□ -1.31
SYF1Q04048 PGU1YJR153W 1086 nt6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87.7 ms