Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAP1AP62834 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAP1AP62834 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAP1AP62834 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAP1AP62834 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAP1AP62834 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAP1AP62834 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAP1AP62834 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAP1AP62834 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RAP1AP62834 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAP1AP62834 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAP1AP62834 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAP1AP62834 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAP1AP62834 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms