Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARFIP2P53365 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms