Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRIM2P49643 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 732.7 ms