Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 CIN4YMR138W 576 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 RPL7BYPL198W 735 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 PKC1YBL105C 3456 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 STE13YOR219C 2796 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 ESC8YOL017W 2145 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 HSP78YDR258C 2436 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 LSG1YGL099W 1923 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 XBP1YIL101C 1944 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 PHB1YGR132C 864 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 QRI5YLR204W 336 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 AFG1YEL052W 1530 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 HAS1YMR290C 1518 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 PCS60YBR222C 1632 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YPK2YMR104C 2034 nt5.01□□□□□ -1.61
CCS1P40202 TEL2YGR099W 2067 nt5□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YER148W-AYER148W-A 579 nt5□□□□□ -1.61
CCS1P40202 LEU5YHR002W 1074 nt5□□□□□ -1.61
CCS1P40202 DJP1YIR004W 1299 nt5□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YLR184WYLR184W 348 nt5□□□□□ -1.61
CCS1P40202 TAL1YLR354C 1008 nt5□□□□□ -1.61
CCS1P40202 CLB2YPR119W 1476 nt5□□□□□ -1.61
CCS1P40202 SAC6YDR129C 1929 nt4.99□□□□□ -1.61
CCS1P40202 RPS2YGL123W 765 nt4.99□□□□□ -1.61
CCS1P40202 DOT5YIL010W 648 nt4.99□□□□□ -1.61
CCS1P40202 GCV3YAL044C 513 nt4.99□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt4.99□□□□□ -1.61
CCS1P40202 ERC1YHR032W 1746 nt4.98□□□□□ -1.61
CCS1P40202 BZZ1YHR114W 1902 nt4.98□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.98□□□□□ -1.61
CCS1P40202 SUB2YDL084W 1341 nt4.97□□□□□ -1.61
CCS1P40202 DIA3YDL024C 1407 nt4.97□□□□□ -1.61
CCS1P40202 SKS1YPL026C 1509 nt4.97□□□□□ -1.61
CCS1P40202 GIT1YCR098C 1557 nt4.97□□□□□ -1.61
CCS1P40202 FZF1YGL254W 900 nt4.97□□□□□ -1.61
CCS1P40202 RME1YGR044C 903 nt4.97□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.97□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YFR006WYFR006W 1608 nt4.97□□□□□ -1.61
CCS1P40202 FYV1YDR024W 486 nt4.96□□□□□ -1.62
CCS1P40202 NPA3YJR072C 1158 nt4.96□□□□□ -1.62
CCS1P40202 CRZ1YNL027W 2037 nt4.96□□□□□ -1.62
CCS1P40202 COX20YDR231C 618 nt4.95□□□□□ -1.62
CCS1P40202 GAL83YER027C 1254 nt4.95□□□□□ -1.62
CCS1P40202 BUD32YGR262C 786 nt4.95□□□□□ -1.62
CCS1P40202 LYS12YIL094C 1116 nt4.95□□□□□ -1.62
CCS1P40202 MRPS5YBR251W 924 nt4.95□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YFL042CYFL042C 2025 nt4.95□□□□□ -1.62
CCS1P40202 PRI2YKL045W 1587 nt4.95□□□□□ -1.62
CCS1P40202 IVY1YDR229W 1362 nt4.94□□□□□ -1.62
CCS1P40202 KSS1YGR040W 1107 nt4.94□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YHC3YJL059W 1227 nt4.94□□□□□ -1.62
CCS1P40202 IMD1YAR073W 1212 nt4.94□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YOL131WYOL131W 327 nt4.94□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YBR124WYBR124W 360 nt4.94□□□□□ -1.62
CCS1P40202 ATP1YBL099W 1638 nt4.94□□□□□ -1.62
CCS1P40202 IDP1YDL066W 1287 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 CHO1YER026C 831 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 CLB1YGR108W 1416 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 HSP150YJL159W 1242 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YEH1YLL012W 1722 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 UBC11YOR339C 471 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 ATF1YOR377W 1578 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 APE3YBR286W 1614 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 VNX1YNL321W 2727 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 ADE12YNL220W 1302 nt4.93□□□□□ -1.62
CCS1P40202 VRP1YLR337C 2454 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YRF1-4YLR466W 4149 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 GUA1YMR217W 1578 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 MTC5YDR128W 3447 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YDL057WYDL057W 987 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YDR109CYDR109C 2148 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 POR2YIL114C 846 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 STM1YLR150W 822 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YML012C-AYML012C-A 378 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 SCO2YBR024W 906 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 MID1YNL291C 1647 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YME1YPR024W 2244 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 KEX2YNL238W 2445 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 FAT3YKL187C 2253 nt4.92□□□□□ -1.62
CCS1P40202 MOG1YJR074W 657 nt4.91□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YOR300WYOR300W 309 nt4.91□□□□□ -1.62
CCS1P40202 SGV1YPR161C 1974 nt4.91□□□□□ -1.62
CCS1P40202 MSS1YMR023C 1581 nt4.91□□□□□ -1.62
CCS1P40202 GEX1YCL073C 1848 nt4.9□□□□□ -1.62
CCS1P40202 GEX2YKR106W 1848 nt4.9□□□□□ -1.62
CCS1P40202 DUG1YFR044C 1446 nt4.9□□□□□ -1.62
CCS1P40202 YER010CYER010C 705 nt4.9□□□□□ -1.63
CCS1P40202 PFA3YNL326C 1011 nt4.9□□□□□ -1.63
CCS1P40202 CWC27YPL064C 906 nt4.9□□□□□ -1.63
CCS1P40202 MRP51YPL118W 1035 nt4.9□□□□□ -1.63
CCS1P40202 TKL1YPR074C 2043 nt4.89□□□□□ -1.63
CCS1P40202 RNR3YIL066C 2610 nt4.89□□□□□ -1.63
CCS1P40202 SCT1YBL011W 2280 nt4.88□□□□□ -1.63
CCS1P40202 SNZ3YFL059W 897 nt4.88□□□□□ -1.63
CCS1P40202 SNZ2YNL333W 897 nt4.88□□□□□ -1.63
CCS1P40202 ENV7YPL236C 1095 nt4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms