Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2H1P32780 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2H1P32780 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2H1P32780 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2H1P32780 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2H1P32780 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2H1P32780 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H1P32780 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H1P32780 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H1P32780 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms