Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCATO75600 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GCATO75600 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCATO75600 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCATO75600 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCATO75600 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCATO75600 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCATO75600 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCATO75600 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCATO75600 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCATO75600 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCATO75600 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCATO75600 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCATO75600 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCATO75600 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCATO75600 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCATO75600 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCATO75600 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GCATO75600 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCATO75600 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCATO75600 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCATO75600 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCATO75600 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCATO75600 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCATO75600 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCATO75600 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCATO75600 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCATO75600 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCATO75600 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCATO75600 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCATO75600 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCATO75600 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCATO75600 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCATO75600 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCATO75600 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCATO75600 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCATO75600 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCATO75600 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GCATO75600 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCATO75600 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GCATO75600 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCATO75600 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCATO75600 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCATO75600 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCATO75600 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCATO75600 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GCATO75600 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCATO75600 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCATO75600 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCATO75600 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCATO75600 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCATO75600 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCATO75600 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCATO75600 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCATO75600 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCATO75600 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCATO75600 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GCATO75600 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCATO75600 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCATO75600 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCATO75600 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCATO75600 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCATO75600 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCATO75600 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms