Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms