Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00587B1AMM8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00587B1AMM8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms