Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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HDGFL3Q9Y3E1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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HDGFL3Q9Y3E1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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HDGFL3Q9Y3E1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDGFL3Q9Y3E1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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