Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBD1Q9UIS9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms