Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP35Q9P2H5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms