Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms