Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDGFDQ9GZP0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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